Predsednik SLS je na predčasnem volilnem Kongresu 16. maja 2009 postal mag. Radovan Žerjav. Kot predsednik stranke predstavlja in zastopa stranko ter vodi izvršilni odbor stranke.

Podpredsednika pomagata pri vodenju stranke. Vsak podpredsednik je posebej zadolžen za določeno področje, ki ga na predlog predsednika stranke določi Izvršilni odbor stranke. 

Kongres stranke je najvišji organ stranke, ki ga skliče Svet stranke na vsaka štiri leta. Kongres je sklepčen, če mu prisostvuje večina vseh delegatov-tk.

Glavni odbor je najvišji odbor stranke med dvema kongresoma. Ima predsednika in dva podpredsednika, ki ju izvoli na svoji prvi seji po kongresu na predlog članov-ic glavnega odbora. 

Predsednik sveta skliče seje sveta po potrebi, vendar pa najmanj enkrat na tri mesece. Sestavlja ga petindvajset članov, ki jih izvoli kongres vključno s predsednikom ter po en predstavnik vsakega regionalnega odbora. 

Predsednik stranke je obenem tudi predsednik izvršilnega odbora, prvi podpredsednik stranke (tisti, ki je na volitvah dobil največje število glasov med podpredsedniki) pa je podpredsednik izvršilnega odbora.

Nadzorni odbor stranke spremlja in nadzoruje finančno in materialno poslovanje stranke, realizacijo sprejetih sklepov ter delovanje organov skladno s statutom stranke.

Programski odbor je stalno strokovno delovno telo izvršilnega odbora. Programski odbor je odgovoren za pregled nad izvrševanjem programa stranke, politiko njegovega uveljavljanja ter pripravo predlogov njegovega dopolnjevanja.

Strankino razsodišče odloča o spornih vprašanjih v zvezi s članstvom v stranki, o izrekanju ukrepov proti članicam – om stranke, ki kršijo statut in druga pravila stranke, o sporih  glede pristojnosti posameznih organov stranke ter o drugih spornih vprašanjih v stranki, za katerih reševanje po statutu ni pristojen kakšen drug organ.

V okviru Slovenske ljudske stranke deluje več zvez, klubov in gibanj: Slovenska kmečka zveza, Slovenska narodna zveza, Zelena zveza, Zveza upokojencev, Klub županov SLS, Slovenska ženska zveza in Klub SP.

Nova generacija SLS je nevladna mladinska organizacija, ki tvori podmladek Slovenske ljudske stranke. Združuje mlade med 15. in 30. letom starosti iz vse Slovenije.